ניתוח זעיר פולשני, הידוע גם בשם ניתוח עמוד שידרה אנדוסקופי, נקרא כך מכיוון שהניתוח מתבצע דרך חתך קטן (אחד או יותר) שדרכו מוחדר אנדוסקופ או רטרקטור צינורי.
הרטרקטור הצינורי מרחיב ומפריד את השרירים והרקמות הרכות משדה הניתוח באופן עדין והדרגתי ומונע את הצורך לחתוך ולנתק את שרירי גב מן החוליות. הניתוח מתבצע דרך הצינור על ידי השימוש במיכשור מיוחד ובאמצעי ראיה מיקרוסקופים. באמצעות מכשירים אילו, דרך חתך ניתוח של כ 1.5 ס"מ, יכול המנתח להיכנס אל תוך תעלת השדרה ולנקות אותה מהדיסק הפרוץ הגורם ללחץ על שק השדרה ושורשי העצבים.
אנדוסקופ הוא צינור דק עם מקור אור ומצלמה. השימוש בו נפוץ גם בניתוחים אורטופדיים כמו ארטרוסקופיות של מפרק הברך או הכתף. האנדוסקופ מוחדר דרך חתך קטן וממוקם לפי הצורך. השימוש באנדוסקופ עם מצלמה מאפשר למנתח לעקוב אחר הניתוח על גבי צג טלוויזיה. ניתן להעביר מכשירים ניתוחיים זעירים דרך האנדוסקופ לשדה הניתוח.  קוטרו הצר של האנדוסקופ מאפשר גישה ניתוחית לתוך התעלה השדרתית ללא הצורך לבצע כריתה נרחבת של החוליה (הלמינה) לצורך מציאת הדיסק הפרוץ וכריתתו.
אופציה נוספת היא שימוש במיקרוסקופ ניתוחי לביצוע הניתוח. שימוש במיקרוסקופ ניתוחי בדומה לאנדוסקופ גם הוא  נפוץ בתחומים כירורגיים רבים אחרים ביניהם ניתוחי מוח ובניתוחים מיקרו-כירורגיים משחזרים. שתי השיטות הוכיחו יעילות דומה לזו המוסגת בניתוח פתוח תוך מיזעור החתך הניתוחי והכאב.